生物工程是當代高科技主要領域之一，是一門涉及基因工程、細胞工程、酶工程和發酵工程等學科的工程技術性學科。學生主要學習高等數學、有機化學、物理化學、生物化學、微生物學、傳遞過程與單元操作、生化反應工程、生物分離工程、生化過程自動化技術、生物工藝學、分子生物學、基因工程、生物制品等課程，并開展相關專業技能訓練和科研技能訓練。專業主要培養能在生物技術與工程領域從事設計、生産、管理和新技術研究、新産品開發的高級應用型工程技術人才。

畢業生可在各類生物制藥公司、生物疫苗廠、生物試劑公司等企業從事生産、技術管理、産品質量檢測、工程菌株選育及研究開發等工作；在食品與藥品監督、質量技術監督、進出口檢驗等部門從事技術行政管理工作；在藥檢所、疾病控制中心等從事技術與檢驗工作；在高等職業技術學院、科研院所等從事生物制藥、生物工程和技術等方面的教學和科研工作；也可進一步考取研究生、國家公務員或出國留學深造，2022屆畢業生研究生錄取率達55%。